Если в свою очередь – это вводное слово, мы его обособляем. Вводные слова в лингвистике называются модальными. Модальность – это смысловая категория, выражающая отношение говорящего к содержанию его высказывания. Например, если человек говорит «наверное, он позвонит», то модальное слово наверное выражает неуверенность. Если мы говорим «во-первых, во-вторых», то этими модальными словами обозначаем структуру того, что говорим.
То есть вводное слово – это не просто такое слово, после которого зачем-то надо поставить запятую. Обособление это всегда отделяет модальность – авторское отношение – от самого высказывания.
Если в свою очередь выступает как модальное слово и указывает на то, что высказывание связано с предыдущим, мы его обособляем: «Он не понимал, что произойдёт дальше. Мы, в свою очередь, старались его предостеречь».
Если же в свою очередь такой функцией не обладает, то перед вами член предложения – обособлять его не нужно: «К тому же он раболепно заискивал у Петра Степановича, который в свою очередь приобрел к тому времени уже до странности сильное влияние на Юлию Михайловну...» (Ф.М. Достоевский «Бесы»).