Разница в том, что прилагательное вторичный – полисемант, то есть имеет несколько значений, а прилагательное повторный – однозначное.

Повторный – представляющий собой повторение, вторичный. Например, повторная встреча. Встреча, которая состоялась еще раз.

Вторичный – совершаемый, используемый во второй раз, образующий вторую ступень в чём-нибудь, представляющий собой вторую стадию в развитии чего-нибудь. Также это слово может передавать значение второстепенности, побочности, следствия, неоригинальности, чего слово повторный делать не может, поэтому в этих значениях его употреблять нельзя.

Также можно сказать, что в последнее время у слова вторичный формируется официальный оттенок, в то время как слово повторный нейтрально.

Итак, верно и вторично, и повторно, но для правильного выбора следует обращать внимание на значение